Susunan Organisasi Pemerintah Desa Proto
Kepala Desa: FUAD
Sekretaris Desa: ZIMAMUL HAQ, S.Kom
Kepala Urusan Perencanaan dan Umum : AMINUDDIN
Kepala Urusan Keuangan: SOLEHUDIN
Kepala Seksi Kesejahteraan dan Pelayanan: EDY MURTADLO, S.E,Sy
Kepala Seksi Pemerintahan : MUHAMMAD SHOBIRIN
Kepala Dusun I : Mugi Santoso
Kepala Dusun II : Dakhori
Kepala Dusun III : Avianti Dwi Putri, S.Pd.